Luzik, D.A., Rogacheva, O.N., Izmailov, S.A., Indeykina, M.I., Kononikhin, A.S., Skrynnikov, N.R. Molecular Dynamics model of peptide-protein conjugation: case study of covalent complex between Sos1 peptide and N-terminal SH3 domain from Grb2. Scientific Reports 2019, 9(1).
DOI: 10.1038/s41598-019-56078-7
Tags: Измайлов, Лузик, Рогачева, Скрынников
Борис Харьков, Сергей Измайлов, Севастьян Рабдано, Николай Скрынников, Дмитрий Лузик, Ольга Рогачева и Иван Подкорытов приняли участие в четвертой ежегодной конференции института трансляционной биомедицины, прошедшей в 20-22 июля 2018 в Санкт-Петербурге.
Сергей Измайлов представил доклад «Метки ЭПР в качестве зонда для исследования белковых систем: о чём говорят спектры».
Иван Подкорытов представил доклад «Исследование подвижных участков белка Sup35NM в мономерах и в составе фибрилл методами ЯМР с диффузионным фильтром».
Ольга Рогачева представила доклад «Биоконъюгация пептидов в контексте таргетной терапии: моделирование и эксперимент».
Дмитрий Лузик представил доклад «Covalent binding of modified Sos1-derived peptide and N-terminal SH3-domain of adapter protein Grb2».
Севастьян Рабдано представил доклад «ESR spectroscopy as a probe of protein dynamics: an insight from long MD simulations».
Tags: Измайлов, Лузик, Подкорытов, Рабдано, Рогачева, Скрынников, Харьков
Сергей Измайлов, Севастьян Рабдано, Николай Скрынников, Борис Харьков и Владислав Саликов приняли участие в 15-й международной школе-конференции «Магнитный резонанс и его приложения, Spinus» прошедшей 1-6 апреля 2018 г.
Сергей Измайлов представил доклад «EPR spectra simulation from MD data using Redfield theory and direct propagation method».
Севастьян Рабдано представил доклад «Dynamic modes in spin-labeled protein revealed by MD simulations: experimental and computed EPR spectra».
Николай Скрынников представил лекцию «Many faces of disulfide bond».
Борис Харьков представил доклад «Skin-Effect Compensated Optimal Control Pulses for Excitation in a Conductive Medium».
Владислав Саликов представил постер «Optimization of bacterial expression of MdmX N-terminal domain for NMR studies».
Tags: Измайлов, Рабдано, Саликов, Скрынников, Харьков
Rogacheva, O. N.; Izmailov, S. A.; Slipchenko, L. V.; Skrynnikov, N. R. A New Structural Arrangement in Proteins Involving Lysine NH3 + Group and Carbonyl. Scientific Reports 2017, 7 (1).
DOI: 10.1038/s41598-017-16584-y.
Tags: Измайлов, Рогачева, Скрынников
Rabdano, S. O.; Izmailov, S. A.; Luzik, D. A.; Groves, A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Onset of Disorder and Protein Aggregation due to Oxidation-Induced Intermolecular Disulfide Bonds: Case Study of RRM2 Domain from TDP-43. Scientific Reports 2017, 7 (1), 11161.
DOI: 10.1038/s41598-017-10574-w.
Tags: Измайлов, Лузик, Подкорытов, Рабдано, Скрынников
Luzik, D. A.; Rabdano, S. O.; Skrynnikov, N. R. Non-Native Disulfide Bridges in Protein-Peptide Complex and in Protein Homodimers Trigger Unfolding and Aggregation. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 212.
DOI: 10.1111/febs.14174.
Tags: Лузик, Рабдано, Скрынников
Rogacheva, O. N.; Izmailov, S. A.; Slipchenko, L. V.; Skrynnikov, N. R. Non-Native Disulfide Bridges in Protein-Peptide Complex and in Protein Homodimers Trigger Unfolding and Aggregation. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 311.
DOI: 10.1111/febs.14174.
Tags: Измайлов, Рогачева, Скрынников
Rabdano, S.; Podkorytov, I.; Luzik, D.; Skrynnikov, N. Characterizing the Size of Protein Aggregate Particles Using a Combination of NMR Diffusion Measurements and Dynamic Light Scattering: Case Study of RRM2 Domain from Protein TDP-43. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 212.
DOI: 10.1111/febs.14174.
Tags: Лузик, Подкорытов, Рабдано, Скрынников
Podkorytov, I. S.; Belousov, M.; Bondarev, S.; Kaempf, K.; Zhouravleva, G.; Dvinskikh, S. V.; Skrynnikov, N. R. Detection of Flexible Portion of Protein Chain in Sup35NM Amyloid Fibrils by Means of Diffusion-Filtered NMR Experiment. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 215.
DOI: 10.1111/febs.14174.
Tags: Кемпф, Подкорытов, Скрынников
Kaempf, K.; Rabdano, S. O.; Izmailov, S. A.; Groves, A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Local and Global Dynamics of Intrinsically Disordered Proteins: A Case Study of H4 Histone Tail. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 95.
DOI: 10.1111/febs.14171.
(далее…)
Tags: Измайлов, Кемпф, Подкорытов, Рабдано, Скрынников
