Luzik, D. A.; Rabdano, S. O.; Skrynnikov, N. R. Non-Native Disulfide Bridges in Protein-Peptide Complex and in Protein Homodimers Trigger Unfolding and Aggregation. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 212.
DOI: 10.1111/febs.14174.
Tags: Лузик, Рабдано, Скрынников
Rabdano, S.; Podkorytov, I.; Luzik, D.; Skrynnikov, N. Characterizing the Size of Protein Aggregate Particles Using a Combination of NMR Diffusion Measurements and Dynamic Light Scattering: Case Study of RRM2 Domain from Protein TDP-43. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 212.
DOI: 10.1111/febs.14174.
Tags: Лузик, Подкорытов, Рабдано, Скрынников
Kaempf, K.; Rabdano, S. O.; Izmailov, S. A.; Groves, A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Local and Global Dynamics of Intrinsically Disordered Proteins: A Case Study of H4 Histone Tail. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 95.
DOI: 10.1111/febs.14171.
(далее…)
Tags: Измайлов, Кемпф, Подкорытов, Рабдано, Скрынников
15-16 июля 2017 года состоялась III ежегодная конференция Института Трансляционной Биомедицины СПбГУ «Актуальные проблемы трансляционной биомедицины — 2017». Конференция объединяет учёных ИТБМ всех направлений, а также приглашенных ученых, работающих в смежных областях, из Санкт-Петербурга, Москвы и из-за рубежа.
В конференции приняли участие Николай Скрынников, Иван Подкорытов, Дмитрий Лузик, Ольга Рогачева, Севастьян Рабдано, Сергей Измайлов, Али Шабан и Олег Михайловский.
Николай Скрынников представил лекцию “Обзор исследований в области экспериментальной биофизики, клеточной биологии и компьютерного моделирования, проводимых в Лаборатории биомолекулярного ЯМР СПбГУ”.
Иван Подкорытов представил постер “Применение ЯМР эксперимента с диффузионным фильтром для детектирования сигнала гибкой части амилоидных фибрилл Sup35NM”.
Дмитрий Лузик представил постер “Ковалентное связывание пептидного лиганда с SH2 доменом Fyn киназы и его последствия в виде агрегации и снижения структурной стабильности домена”.
Ольга Рогачева представила постер “Новое взаимодействие между группой NH3+ лизина и карбонилами основной цепи, дополняющее водородные связи”.
Севастьян Рабдано представил постер “Потеря структуры и агрегация белка при возникновении дисульфидных мостиков под воздействием окислительного стресса: пример домена RRM2 из нейропатологического белка TDP-43”.
Сергей Измайлов представил постер “Простая модель оксидативного сворачивания пептидов и белков в молекулярной динамике”.
Али Шабан представил постер “Библиотека Матлаб для аппроксимации сигналов в двумерных ЯМР спектрах”.
Tags: Измайлов, Лузик, Подкорытов, Рабдано, Рогачева, Скрынников, Тюряева
Николай Скрынников, Владислав Саликов и Севастьян Рабдано приняли участие в конференции Spinus 2017 — Магнитный резонанс и его приложения.
Николай Скрынников представил лекцию “Recent results from the Laboratory of biomolecular NMR @ SPbGU: from mechanism of anti-cancer peptides to characterization of flexible tails in amyloid fibrils”.
Севастьян Рабдано представил устный доклад “Reconstruction of particle size-distribution from conjunction of NMR and DLS diffusion data”.
Владислав Саликов представил устный доклад “Analysis of NMR spectra of alizarin and alizarin red S”.
Tags: Рабдано, Саликов, Скрынников
Севастьян Рабдано был приглашен сделать доклад на локальном мероприятии TED – TEDxSPBU. Название доклада “Can we use negative impact of oxidants in positive way?”
Tags: Рабдано
Севастьян Рабдано, Сергей Измайлов и Дмитрий Лузик приняли участие в хакатоне по биоинформатике BioHack 2017.
Сергей Измайлов руководил командой, которая работала над проектом «Идентификация онкогенных белков в качестве мишеней для ковалентно связывающихся пептидов».
Дмитрий Лузик был в команде, которая работала над проектом «Интерактом протеоформ человека».
Севастьян Рабдано был в команде, которая работала над проектом «Исследование связанных состояний молекул воды в интерфейсах биомакромолекул». Его команда заняла третье место и была награждена организаторами.
Н.Р Скрынников, И.С. Подкорытов, С.А. Измайлов, О.Н. Рогачева, К. Кемпф и С.О. Рабдано приняли участие в конференции XXXVIII Finnish NMR Symposium, Ювяскюля, Финляндия.
Н.Р. Скринников представил лекцию «Dynamics in Protein Crystals: Insights From MD Simulations Complement New Solid-State NMR And X-Ray Data».
Керстин представила устный доклад “Local and global dynamics of intrinsically disordered proteins: a case study of H4 histone tail“.
И.С. Подкорытов представил постер “Diffusion-filtered experiment to detect flexible portion of protein chain in amyloid fibrils: application to Sup35NM“.
С.А. Измайлов представил постер “Simple MD-based model for oxidative folding of peptides and proteins”.
О.Н. Рогачева представила постер “Using molecular dynamics simulation and chemical shift prediction to unravel dynamics in different crystal forms of ubiquitin”.
С.О. Рабдано представил постер “Loss of protein stability due to formation of intermolecular disulfide bonds under the effect of oxidative stress: case study of the RRM2 domain from neuropathological protein TDP-43”.
Tags: Измайлов, Кемпф, Подкорытов, Рабдано, Рогачева, Скрынников, Финляндия, Ювяскюля
Севастьян Рабдано и Сергей Измайлов приняли участие конференции Biophysical Society 60th annual meeting, Лос-Анджелес, Калифорния, США. Они представили результаты по проектам RRM2 и Guanylin oxidative folding.
Севастьян представил постер “Loss of protein stability due to formation of intermolecular disulfide bonds under the effect of oxidative stress: case study of the RRM2 domain from neuropathological protein TDP-43”.
Сергей представил постер «MD Modeling of Oxidative Folding in Peptides and Proteins».
