Varshavsky, Yu. S., Cherkasova, T. G., Galding, M. R., Korlyukov, A. A., Podkorytov, I. S., Gindin, V. A., Smirnov, S. N., Mazur, A. S. & Rubaylo, A. I. 13C NMR spectrum of crystalline [Rh(Acac) (CO)2]: A contribution to the discussion on [Rh(Acac) (CO)2] molecular structure in the solid state. Journal of Organometallic Chemistry 874, 70–73 (2018).
DOI: 10.1016/j.jorganchem.2018.08.009
Tags: Подкорытов
Борис Харьков, Сергей Измайлов, Севастьян Рабдано, Николай Скрынников, Дмитрий Лузик, Ольга Рогачева и Иван Подкорытов приняли участие в четвертой ежегодной конференции института трансляционной биомедицины, прошедшей в 20-22 июля 2018 в Санкт-Петербурге.
Сергей Измайлов представил доклад «Метки ЭПР в качестве зонда для исследования белковых систем: о чём говорят спектры».
Иван Подкорытов представил доклад «Исследование подвижных участков белка Sup35NM в мономерах и в составе фибрилл методами ЯМР с диффузионным фильтром».
Ольга Рогачева представила доклад «Биоконъюгация пептидов в контексте таргетной терапии: моделирование и эксперимент».
Дмитрий Лузик представил доклад «Covalent binding of modified Sos1-derived peptide and N-terminal SH3-domain of adapter protein Grb2».
Севастьян Рабдано представил доклад «ESR spectroscopy as a probe of protein dynamics: an insight from long MD simulations».
Tags: Измайлов, Лузик, Подкорытов, Рабдано, Рогачева, Скрынников, Харьков
Иван Подкорытов, Севастьян Рабдано, Ольга Рогачева, Керстин Кемпф и Дмитрий Лузик участвовали в конгрессе FEBS в Иерусалиме, Израиль.
Керстин Кемпф представила устный доклад “Local and global dynamics of intrinsically disordered proteins: a case study of H4 histone tail”.
Иван Подкорытов представил постер “Detection of flexible portion of protein chain in Sup35NM amyloid fibrils by means of diffusion-filtered NMR experiment”.
Севастьян Рабдано представил постер “Characterizing the Size of Protein Aggregate Particles Using a Combination of NMR Diffusion Measurements and Dynamic Light Scattering: Case Study of RRM2 Domain from Protein TDP-43”.
Ольга Рогачева представила постер “New linear interaction between charged lysine side chain and carbonyl group in protein structures”.
Дмитрий Лузик представил постер “Non-native disulfide bridges in protein-peptide complex and in protein homodimers trigger unfolding and aggregation”.
Tags: Иерусалим, Израиль, Кемпф, Лузик, Подкорытов, Рабдано, Рогачева
Rabdano, S. O.; Izmailov, S. A.; Luzik, D. A.; Groves, A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Onset of Disorder and Protein Aggregation due to Oxidation-Induced Intermolecular Disulfide Bonds: Case Study of RRM2 Domain from TDP-43. Scientific Reports 2017, 7 (1), 11161.
DOI: 10.1038/s41598-017-10574-w.
Tags: Измайлов, Лузик, Подкорытов, Рабдано, Скрынников
Rabdano, S.; Podkorytov, I.; Luzik, D.; Skrynnikov, N. Characterizing the Size of Protein Aggregate Particles Using a Combination of NMR Diffusion Measurements and Dynamic Light Scattering: Case Study of RRM2 Domain from Protein TDP-43. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 212.
DOI: 10.1111/febs.14174.
Tags: Лузик, Подкорытов, Рабдано, Скрынников
Podkorytov, I. S.; Belousov, M.; Bondarev, S.; Kaempf, K.; Zhouravleva, G.; Dvinskikh, S. V.; Skrynnikov, N. R. Detection of Flexible Portion of Protein Chain in Sup35NM Amyloid Fibrils by Means of Diffusion-Filtered NMR Experiment. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 215.
DOI: 10.1111/febs.14174.
Tags: Кемпф, Подкорытов, Скрынников
Kaempf, K.; Rabdano, S. O.; Izmailov, S. A.; Groves, A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Local and Global Dynamics of Intrinsically Disordered Proteins: A Case Study of H4 Histone Tail. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 95.
DOI: 10.1111/febs.14171.
(далее…)
Tags: Измайлов, Кемпф, Подкорытов, Рабдано, Скрынников
Izmailov, S. A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Simple MD-Based Model for Oxidative Folding of Peptides and Proteins. Scientific Reports 2017, 7 (1).
DOI: 10.1038/s41598-017-09229-7.
Tags: Измайлов, Подкорытов, Скрынников
15-16 июля 2017 года состоялась III ежегодная конференция Института Трансляционной Биомедицины СПбГУ «Актуальные проблемы трансляционной биомедицины — 2017». Конференция объединяет учёных ИТБМ всех направлений, а также приглашенных ученых, работающих в смежных областях, из Санкт-Петербурга, Москвы и из-за рубежа.
В конференции приняли участие Николай Скрынников, Иван Подкорытов, Дмитрий Лузик, Ольга Рогачева, Севастьян Рабдано, Сергей Измайлов, Али Шабан и Олег Михайловский.
Николай Скрынников представил лекцию “Обзор исследований в области экспериментальной биофизики, клеточной биологии и компьютерного моделирования, проводимых в Лаборатории биомолекулярного ЯМР СПбГУ”.
Иван Подкорытов представил постер “Применение ЯМР эксперимента с диффузионным фильтром для детектирования сигнала гибкой части амилоидных фибрилл Sup35NM”.
Дмитрий Лузик представил постер “Ковалентное связывание пептидного лиганда с SH2 доменом Fyn киназы и его последствия в виде агрегации и снижения структурной стабильности домена”.
Ольга Рогачева представила постер “Новое взаимодействие между группой NH3+ лизина и карбонилами основной цепи, дополняющее водородные связи”.
Севастьян Рабдано представил постер “Потеря структуры и агрегация белка при возникновении дисульфидных мостиков под воздействием окислительного стресса: пример домена RRM2 из нейропатологического белка TDP-43”.
Сергей Измайлов представил постер “Простая модель оксидативного сворачивания пептидов и белков в молекулярной динамике”.
Али Шабан представил постер “Библиотека Матлаб для аппроксимации сигналов в двумерных ЯМР спектрах”.
Tags: Измайлов, Лузик, Подкорытов, Рабдано, Рогачева, Скрынников, Тюряева
Tyuryaeva, I. I., Lyublinskaya, O. G., Podkorytov, I. S. & Skrynnikov, N. R. «Origin of anti-tumor activity of the cysteine-containing GO peptides and further optimization of their cytotoxic properties» Scientific Reports 7, 40217 (2017).
DOI: 10.1038/srep40217
Tags: Люблинская, Подкорытов, Скрынников, Тюряева
