• Русский
  • English

Записи с тэгом ‘Измайлов’

4-я ежегодная конференция Института Трансляционной Биомедицины СПбГУ, Санкт-Петербург

Опубликовано: 20.07.2018

Борис Харьков, Сергей Измайлов, Севастьян Рабдано, Николай Скрынников, Дмитрий Лузик, Ольга Рогачева и Иван Подкорытов приняли участие в четвертой ежегодной конференции института трансляционной биомедицины, прошедшей в 20-22 июля 2018 в Санкт-Петербурге.

Сергей Измайлов представил доклад «Метки ЭПР в качестве зонда для исследования белковых систем: о чём говорят спектры».

Иван Подкорытов представил доклад «Исследование подвижных участков белка Sup35NM в мономерах и в составе фибрилл методами ЯМР с диффузионным фильтром».

Ольга Рогачева представила доклад «Биоконъюгация пептидов в контексте таргетной терапии: моделирование и эксперимент».

Дмитрий Лузик представил доклад «Covalent binding of modified Sos1-derived peptide and N-terminal SH3-domain of adapter protein Grb2».

Севастьян Рабдано представил доклад «ESR spectroscopy as a probe of protein dynamics: an insight from long MD simulations».

Tags: , , , , , ,

FEBS Congress 2018, Prague, Czech Republic

Опубликовано: 07.07.2018

Севастьян Рабдано и Сергей Измайлов приняли участие в конгрессе FEBS прошедшем 7-12 июля 2018 г. в Праге.

Севастьян Рабдано представил постер «ESR spectroscopy as a probe of protein dynamics: the effect of different motional modes on the simulated lineshapes».

Сергей Измайлов представил постер «ESR spectroscopy as a probe of protein dynamics: an insight from long MD simulations».

Tags: ,

15-th International School-Conference Magnetic resonance and its applications Spinus 2018

Опубликовано: 01.04.2018

Сергей Измайлов, Севастьян Рабдано, Николай Скрынников, Борис Харьков и Владислав Саликов приняли участие в 15-й международной школе-конференции «Магнитный резонанс и его приложения, Spinus» прошедшей 1-6 апреля 2018 г.

Сергей Измайлов представил доклад «EPR spectra simulation from MD data using Redfield theory and direct propagation method».

Севастьян Рабдано представил доклад «Dynamic modes in spin-labeled protein revealed by MD simulations: experimental and computed EPR spectra».

Николай Скрынников представил лекцию «Many faces of disulfide bond».

Борис Харьков представил доклад «Skin-Effect Compensated Optimal Control Pulses for Excitation in a Conductive Medium».

Владислав Саликов представил постер «Optimization of bacterial expression of MdmX N-terminal domain for NMR studies».

Tags: , , , ,

A new structural arrangement in proteins involving lysine NH3+ group and carbonyl

Опубликовано: 27.11.2017

Rogacheva, O. N.; Izmailov, S. A.; Slipchenko, L. V.; Skrynnikov, N. R. A New Structural Arrangement in Proteins Involving Lysine NH3 + Group and Carbonyl. Scientific Reports 2017, 7 (1).

DOI: 10.1038/s41598-017-16584-y.

(далее…)

Tags: , ,

Onset of disorder and protein aggregation due to oxidation-induced intermolecular disulfide bonds: case study of RRM2 domain from TDP-43

Опубликовано: 11.09.2017

Rabdano, S. O.; Izmailov, S. A.; Luzik, D. A.; Groves, A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Onset of Disorder and Protein Aggregation due to Oxidation-Induced Intermolecular Disulfide Bonds: Case Study of RRM2 Domain from TDP-43. Scientific Reports 2017, 7 (1), 11161.

DOI: 10.1038/s41598-017-10574-w.

(далее…)

Tags: , , , ,

New linear interaction between charged lysine side chain and carbonyl group in protein structures

Опубликовано: 08.09.2017

Rogacheva, O. N.; Izmailov, S. A.; Slipchenko, L. V.; Skrynnikov, N. R. Non-Native Disulfide Bridges in Protein-Peptide Complex and in Protein Homodimers Trigger Unfolding and Aggregation. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 311.

DOI: 10.1111/febs.14174.

(далее…)

Tags: , ,

Local and global dynamics of intrinsically disordered proteins: a case study of H4 histone tail

Опубликовано: 08.09.2017

Kaempf, K.; Rabdano, S. O.; Izmailov, S. A.; Groves, A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Local and Global Dynamics of Intrinsically Disordered Proteins: A Case Study of H4 Histone Tail. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 95.

DOI: 10.1111/febs.14171.
(далее…)

Tags: , , , ,

Simple MD-based model for oxidative folding of peptides and proteins

Опубликовано: 24.08.2017

Izmailov, S. A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Simple MD-Based Model for Oxidative Folding of Peptides and Proteins. Scientific Reports 2017, 7 (1).

DOI: 10.1038/s41598-017-09229-7.

(далее…)

Tags: , ,

Slow Conformational Exchange and Overall Rocking Motion in Ubiquitin Protein Crystals

Опубликовано: 27.07.2017

Kurauskas, V.; Izmailov, S. A.; Rogacheva, O. N.; Hessel, A.; Ayala, I.; Woodhouse, J.; Shilova, A.; Xue, Y.; Yuwen, T.; Coquelle, N.; Colletier, J.-P.; Skrynnikov, N. R.; Schanda, P. Slow Conformational Exchange and Overall Rocking Motion in Ubiquitin Protein Crystals. Nature Communications 2017, 8 (1).

DOI: 10.1038/s41467-017-00165-8.

(далее…)

Tags: , ,

Конференция Института Трансляционной Биомедицины СПбГУ «Актуальные проблемы трансляционной биомедицины — 2017»

Опубликовано: 16.07.2017

dna-2358911.1961d33827f555101ee91d38be0ea3583237

15-16 июля 2017 года состоялась III ежегодная конференция Института Трансляционной Биомедицины СПбГУ «Актуальные проблемы трансляционной биомедицины — 2017». Конференция объединяет учёных ИТБМ всех направлений, а также приглашенных ученых, работающих в смежных областях, из Санкт-Петербурга, Москвы и из-за рубежа.

В конференции приняли участие Николай Скрынников, Иван Подкорытов, Дмитрий Лузик, Ольга Рогачева, Севастьян Рабдано, Сергей Измайлов, Али Шабан и Олег Михайловский.

Николай Скрынников представил лекцию “Обзор исследований в области экспериментальной биофизики, клеточной биологии и компьютерного моделирования, проводимых в Лаборатории биомолекулярного ЯМР СПбГУ”.

Иван Подкорытов представил постер “Применение ЯМР эксперимента с диффузионным фильтром для детектирования сигнала гибкой части амилоидных фибрилл Sup35NM”.

Дмитрий Лузик представил постер “Ковалентное связывание пептидного лиганда с SH2 доменом Fyn киназы и его последствия в виде агрегации и снижения структурной стабильности домена”.

Ольга Рогачева представила постер “Новое взаимодействие между группой NH3+ лизина и карбонилами основной цепи, дополняющее водородные связи”.

Севастьян Рабдано представил постер “Потеря структуры и агрегация белка при возникновении дисульфидных мостиков под воздействием окислительного стресса: пример домена RRM2 из нейропатологического белка TDP-43”.

Сергей Измайлов представил постер “Простая модель оксидативного сворачивания пептидов и белков в молекулярной динамике”.

Али Шабан представил постер “Библиотека Матлаб для аппроксимации сигналов в двумерных ЯМР спектрах”.

Tags: , , , , , ,

« Older Entries
Newer Entries »