|
Лаборатория биомолекулярного ЯМР |
Kaempf, K.; Rabdano, S. O.; Izmailov, S. A.; Groves, A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Local and Global Dynamics of Intrinsically Disordered Proteins: A Case Study of H4 Histone Tail. The FEBS Journal 2017, 284 (Suppl. 1), 95.
DOI: 10.1111/febs.14171.
Читать далее »
Тэги: Измайлов, Кемпф, Подкорытов, Рабдано, Скрынников
Izmailov, S. A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Simple MD-Based Model for Oxidative Folding of Peptides and Proteins. Scientific Reports 2017, 7 (1).
DOI: 10.1038/s41598-017-09229-7.
Тэги: Измайлов, Подкорытов, Скрынников
Kurauskas, V.; Izmailov, S. A.; Rogacheva, O. N.; Hessel, A.; Ayala, I.; Woodhouse, J.; Shilova, A.; Xue, Y.; Yuwen, T.; Coquelle, N.; Colletier, J.-P.; Skrynnikov, N. R.; Schanda, P. Slow Conformational Exchange and Overall Rocking Motion in Ubiquitin Protein Crystals. Nature Communications 2017, 8 (1).
DOI: 10.1038/s41467-017-00165-8.
Тэги: Измайлов, Рогачева, Скрынников
15-16 июля 2017 года состоялась III ежегодная конференция Института Трансляционной Биомедицины СПбГУ «Актуальные проблемы трансляционной биомедицины — 2017». Конференция объединяет учёных ИТБМ всех направлений, а также приглашенных ученых, работающих в смежных областях, из Санкт-Петербурга, Москвы и из-за рубежа.
В конференции приняли участие Николай Скрынников, Иван Подкорытов, Дмитрий Лузик, Ольга Рогачева, Севастьян Рабдано, Сергей Измайлов, Али Шабан и Олег Михайловский.
Николай Скрынников представил лекцию “Обзор исследований в области экспериментальной биофизики, клеточной биологии и компьютерного моделирования, проводимых в Лаборатории биомолекулярного ЯМР СПбГУ”.
Иван Подкорытов представил постер “Применение ЯМР эксперимента с диффузионным фильтром для детектирования сигнала гибкой части амилоидных фибрилл Sup35NM”.
Дмитрий Лузик представил постер “Ковалентное связывание пептидного лиганда с SH2 доменом Fyn киназы и его последствия в виде агрегации и снижения структурной стабильности домена”.
Ольга Рогачева представила постер “Новое взаимодействие между группой NH3+ лизина и карбонилами основной цепи, дополняющее водородные связи”.
Севастьян Рабдано представил постер “Потеря структуры и агрегация белка при возникновении дисульфидных мостиков под воздействием окислительного стресса: пример домена RRM2 из нейропатологического белка TDP-43”.
Сергей Измайлов представил постер “Простая модель оксидативного сворачивания пептидов и белков в молекулярной динамике”.
Али Шабан представил постер “Библиотека Матлаб для аппроксимации сигналов в двумерных ЯМР спектрах”.
Тэги: Измайлов, Лузик, Подкорытов, Рабдано, Рогачева, Скрынников, Тюряева
Николай Скрынников, Владислав Саликов и Севастьян Рабдано приняли участие в конференции Spinus 2017 — Магнитный резонанс и его приложения.
Николай Скрынников представил лекцию “Recent results from the Laboratory of biomolecular NMR @ SPbGU: from mechanism of anti-cancer peptides to characterization of flexible tails in amyloid fibrils”.
Севастьян Рабдано представил устный доклад “Reconstruction of particle size-distribution from conjunction of NMR and DLS diffusion data”.
Владислав Саликов представил устный доклад “Analysis of NMR spectra of alizarin and alizarin red S”.
Тэги: Рабдано, Саликов, Скрынников
Севастьян Рабдано был приглашен сделать доклад на локальном мероприятии TED – TEDxSPBU. Название доклада “Can we use negative impact of oxidants in positive way?”
Тэги: Рабдано
Севастьян Рабдано, Сергей Измайлов и Дмитрий Лузик приняли участие в хакатоне по биоинформатике BioHack 2017.
Сергей Измайлов руководил командой, которая работала над проектом «Идентификация онкогенных белков в качестве мишеней для ковалентно связывающихся пептидов».
Дмитрий Лузик был в команде, которая работала над проектом «Интерактом протеоформ человека».
Севастьян Рабдано был в команде, которая работала над проектом «Исследование связанных состояний молекул воды в интерфейсах биомакромолекул». Его команда заняла третье место и была награждена организаторами.
Tyuryaeva, I. I., Lyublinskaya, O. G., Podkorytov, I. S. & Skrynnikov, N. R. «Origin of anti-tumor activity of the cysteine-containing GO peptides and further optimization of their cytotoxic properties» Scientific Reports 7, 40217 (2017).
DOI: 10.1038/srep40217
Тэги: Люблинская, Подкорытов, Скрынников, Тюряева
Николай Скрынников участвовал в экспертном совете NIH, Вашингтон, США, 15-17 ноября, 2016.
Тэги: Скрынников
Николай Скрынников организовал конференцию на 120 участников «Chicago Areа NMR Discussion Group (CANMRDG)», Милуоки, США, 5 ноября, 2016.
Тэги: Скрынников