• Русский
  • English

Записи с тэгом ‘Рабдано’

Histone H4 tails in nucleosomes: a fuzzy interaction with DNA

Опубликовано: 24.02.2021

Sevastyan O. Rabdano, Matthew D. Shannon, Sergei A. Izmailov, Nicole Gonzalez Salguero, Mohamad Zandian, Rudra N. Purusottam, Michael G. Poirier, Nikolai R. Skrynnikov and Christopher P. Jaroniec

https://doi.org/10.1002/anie.202012046

(далее…)

Tags: , ,

Structural and dynamic origins of ESR lineshapes in spin-labeled GB1 domain: the insights from spin dynamics simulations based on long MD trajectories

Опубликовано: 22.01.2020

Izmailov, S.A, Rabdano, S.O., Hasanbasri, Z., Podkorytov, I.S., Saxena, S., Skrynnikov, N.R. Structural and dynamic origins of ESR lineshapes in spin-labeled GB1 domain: the insights from spin dynamics simulations based on long MD trajectories. Scientific Reports 2020.

DOI: 10.1038/s41598-019-56750-y

(далее…)

Tags: , , ,

Joint 12-th EBSA 10-th ICBP-IUPAP Biophysics Congress, Madrid, Spain

Опубликовано: 20.07.2019

Севастьян Рабдано принял участие в биофизическом конгрессе Ассоциации Европейских Биофизических Сообществ с устным докладом «Histone tails in nucleosome: fuzzy interaction with DNA». Конференция прошла 20-24 июля 2019 г. в Мадриде.

Tags:

4-я ежегодная конференция Института Трансляционной Биомедицины СПбГУ, Санкт-Петербург

Опубликовано: 20.07.2018

Борис Харьков, Сергей Измайлов, Севастьян Рабдано, Николай Скрынников, Дмитрий Лузик, Ольга Рогачева и Иван Подкорытов приняли участие в четвертой ежегодной конференции института трансляционной биомедицины, прошедшей в 20-22 июля 2018 в Санкт-Петербурге.

Сергей Измайлов представил доклад «Метки ЭПР в качестве зонда для исследования белковых систем: о чём говорят спектры».

Иван Подкорытов представил доклад «Исследование подвижных участков белка Sup35NM в мономерах и в составе фибрилл методами ЯМР с диффузионным фильтром».

Ольга Рогачева представила доклад «Биоконъюгация пептидов в контексте таргетной терапии: моделирование и эксперимент».

Дмитрий Лузик представил доклад «Covalent binding of modified Sos1-derived peptide and N-terminal SH3-domain of adapter protein Grb2».

Севастьян Рабдано представил доклад «ESR spectroscopy as a probe of protein dynamics: an insight from long MD simulations».

Tags: , , , , , ,

FEBS Congress 2018, Prague, Czech Republic

Опубликовано: 07.07.2018

Севастьян Рабдано и Сергей Измайлов приняли участие в конгрессе FEBS прошедшем 7-12 июля 2018 г. в Праге.

Севастьян Рабдано представил постер «ESR spectroscopy as a probe of protein dynamics: the effect of different motional modes on the simulated lineshapes».

Сергей Измайлов представил постер «ESR spectroscopy as a probe of protein dynamics: an insight from long MD simulations».

Tags: ,

Севастьян Рабдано защитил степень кандидата физико-математических наук

Опубликовано: 20.06.2018

20 июня успешно прошла защита диссертации Севастьяна Рабдано «Развитие методов ЯМР для исследования состояния биологических молекул в условиях окислительно-восстановительных процессов». Специальность 01.04.11 «Физика магнитных явлений».

Tags:

15-th International School-Conference Magnetic resonance and its applications Spinus 2018

Опубликовано: 01.04.2018

Сергей Измайлов, Севастьян Рабдано, Николай Скрынников, Борис Харьков и Владислав Саликов приняли участие в 15-й международной школе-конференции «Магнитный резонанс и его приложения, Spinus» прошедшей 1-6 апреля 2018 г.

Сергей Измайлов представил доклад «EPR spectra simulation from MD data using Redfield theory and direct propagation method».

Севастьян Рабдано представил доклад «Dynamic modes in spin-labeled protein revealed by MD simulations: experimental and computed EPR spectra».

Николай Скрынников представил лекцию «Many faces of disulfide bond».

Борис Харьков представил доклад «Skin-Effect Compensated Optimal Control Pulses for Excitation in a Conductive Medium».

Владислав Саликов представил постер «Optimization of bacterial expression of MdmX N-terminal domain for NMR studies».

Tags: , , , ,

BioHack 2018

Опубликовано: 03.03.2018

Команда Севастьяна Рабдано «Good Vibrations» заняла первое место на хакатоне по биоинформатике BIoHack 2018 с проектом «Анализ звукопродукции дрозофилы».

Tags:

FEBS congress, Jerusalem, Israel

Опубликовано: 14.09.2017

Иван Подкорытов, Севастьян Рабдано, Ольга Рогачева, Керстин Кемпф и Дмитрий Лузик участвовали в конгрессе FEBS в Иерусалиме, Израиль.

Керстин Кемпф представила устный доклад “Local and global dynamics of intrinsically disordered proteins: a case study of H4 histone tail”.

Иван Подкорытов представил постер “Detection of flexible portion of protein chain in Sup35NM amyloid fibrils by means of diffusion-filtered NMR experiment”.

Севастьян Рабдано представил постер “Characterizing the Size of Protein Aggregate Particles Using a Combination of NMR Diffusion Measurements and Dynamic Light Scattering: Case Study of RRM2 Domain from Protein TDP-43”.

Ольга Рогачева представила постер “New linear interaction between charged lysine side chain and carbonyl group in protein structures”.

Дмитрий Лузик представил постер “Non-native disulfide bridges in protein-peptide complex and in protein homodimers trigger unfolding and aggregation”.

Tags: , , , , , ,

Onset of disorder and protein aggregation due to oxidation-induced intermolecular disulfide bonds: case study of RRM2 domain from TDP-43

Опубликовано: 11.09.2017

Rabdano, S. O.; Izmailov, S. A.; Luzik, D. A.; Groves, A.; Podkorytov, I. S.; Skrynnikov, N. R. Onset of Disorder and Protein Aggregation due to Oxidation-Induced Intermolecular Disulfide Bonds: Case Study of RRM2 Domain from TDP-43. Scientific Reports 2017, 7 (1), 11161.

DOI: 10.1038/s41598-017-10574-w.

(далее…)

Tags: , , , ,