• Русский
  • English

Weak nuclear spin singlet relaxation mechanisms revealed by experiment and computation

Опубликовано: 23.03.2022
The ability of nuclear spin singlet order (SO) to exhibit lifetimes much longer than spin lattice relaxation times has motivated the investigation into the use of such states as information or polarization storage vehicles. Potential applications include imaging, the study of slow kinetic or dynamic processes, or the study of weak relaxation mechanisms.

B. Kharkov, X. Duan, J. Rantaharju, M. Sabba, M.H. Levitt, J.W. Canary, A. Jerschow

https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2022/cp/d1cp05537b

Читать далее »

Тэги:

Modeling a unit cell: crystallographic refinement procedure using the biomolecular MD simulation platform Amber

Опубликовано: 16.12.2021

Oleg Mikhailovskii, Yi Xue, and Nikolai R. Skrynnikov.

https://doi.org/10.1107/S2052252521011891.

Читать далее »

Тэги: ,

Modern development of magnetic resonance 2021

Опубликовано: 05.11.2021

 

В этом году на первой доступной нам очной конференции приняли участие несколько человек из нашей лаборатории.

Николай Скрынников выступил с приглашённым докладом «Structural and Dynamic Origins of ESR Lineshapes in Spin-Labeled GB1 Domain: the Insights from Experiments and Spin Dynamics Simulations Based on MD Trajectories». Помимо этого, Николай участвовал в качестве председателя на сессии Chemical and Biological Systems (5 ноября 2021 г.).

Ольга Лебеденко выступила с постерным докладом «Validating MD Models of Disordered Proteins Using NMR Data on Translational Diffusion».

Владислав Саликов выступил с постерным докладом «Improved Processing Scheme for Diffusion NMR Data Implemented in Web Server DDfit».

Борис Харьков выступил с устным докладом «The Role of Rotation in Diffusion NMR Experiments on Supramolecular Assemblies».

Конференция прошла в Казани 1-5 ноября 2021 г. в смешанном формате. Тезисы доступны онлайн.

Тэги: , , ,

Выступление Николая Скрынникова на ученом совете медицинского факультета СПбГУ

Опубликовано: 06.10.2021

Николай Скрынников выступил 6 октября 2021 с докладом “Исследования и компетенции Лаборатории био-ЯМР СПбГУ” на заседании ученого совета медицинского факультета СПбГУ, проведенном с использованием видеоконференции в системе MS TEAMS. На заседании присутствовали 19 человек, в том числе председатель ученого совета: и.о. декана медицинского факультета, к.м.н. И.Ю. Пчелин.

Протокол заседания Ученого совета Медицинского факультета

Читать далее »

Тэги:

Сергей Измайлов защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук

Опубликовано: 29.09.2021

29 сентября 2021 успешно прошла защита диссертации Сергеея Измайлова «Разработка и приложение алгоритмов молекулярной динамики и спиновой динамики в исследованиях полипептидных цепей: от неупорядоченных пептидов к кристаллическим белкам». Специальность 05.13.18 — Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ.

Тэги:

Статья в журнале «Наука и жизнь»

Опубликовано: 15.07.2021

В журнале «Наука и жизнь» №7 от 2021 вышла статья «Амилоидные образования отделили от мусора», оснванная на пресс-релизе СПбГУ статьи The Role of Rotational Motion in Diffusion NMR Experiments on Supramolecular Assemblies: Application to Sup35NM Fibrils.

Тэги: , , ,

Статьи «Лови вращение», «В магнитном поле возможностей»

Опубликовано: 30.06.2021
Обложка журнала «Санкт-Петербургский университет» №4 31 июня 2021

О лаборатории биомолекулярного ЯМР СПбГУ были опубликованы две статьи в журнале “Санкт-Петербургский университет” №4 (3930) 31 июня 2021.

В первой статье мы рассказали журналистам о новом способе распознавания спектральных сигналов амилоидных фибрилл, который поможет лучше разобраться в механизме нейродегенеративных заболеваний.

Во второй статье мы рассказали журналистам о лаборатории, целях, задачах и планах на будущее. Лаборатории биомолекулярного ЯМР СПбГУ почти восемь лет. 

Тэги: , , , , , , , ,

Интервью Олега Михайловского ТАСС. Наука о предсказании кристаллических структур белка

Опубликовано: 24.06.2021
Олег Михайловский © Валентина Певцова/ТАСС

Олег Михайловский дал интервью ТАСС о своей работе в области предсказания рентгеновских структур белков, о важности изучения структуры белка. «Один из недавних научных прорывов — создание алгоритмов, которые могут предсказывать структуру белка. В перспективе это позволит создавать новые персонализированные лекарства и новые вакцины прямо на компьютере, за считанные недели и даже дни. Математик и биолог Олег Михайловский рассказал ТАСС о том, как изучают белки, как знание их структуры может помочь врачам и почему ученому полезно быть «многостаночником».» ТАСС Наука (ссылка на полную статью).

Тэги:

Памяти Ричарда Эрнста, Нобелевского лауреата

Опубликовано: 10.06.2021

Николай Скрынников 9 июня 2021 дал интервью для американского издания C&EN в память о Ричарде Эрнсте (Richard R. Ernst), Нобелевском лауреата по химии 1991 «за вклад в развитие методологии спектроскопии ЯМР высокого разрешения». Ричард Эрнст был руководителем Николая Руслановича во времена постдокторантуры:

«…Nikolai Skrynnikov of St. Petersburg University and Purdue University, who studied with Ernst as a postdoctoral researcher, recalls Ernst once writing a letter of recommendation for a US Permanent Resident Card for a scientist Ernst had never met, something he reportedly did regularly…»

Полную версию можно прочитать в источнике.

 

Тэги:

Университетский пресс-релиз о появлении статьи в Angewandte о новой теории диффузионных экспериментов ЯМР для изучения амилоидных фибрилл

Опубликовано: 26.05.2021
Электронный микрограф фибрилл Sup35NM. Данные получены в ресурсном центре «Развитие молекулярных и клеточных технологий» Научного парка СПбГУ.

26 мая 2021 вышел университетский пресс-релиз, посвященный исследованию фибрилл. Коллектив лаборатории создал новую теорию о диффузионных экспериментах ЯМР для изучения амилоидных фибрилл — ключевых факторов, провоцирующих различные формы деменции, включая болезнь Альцгеймера.  Статья с результатами исследования опубликована в одном из самых престижных научных журналов по химии Angewandte Chemie.

Читать далее »

Тэги: , , ,