• Русский
  • English

Slow Conformational Exchange and Overall Rocking Motion in Ubiquitin Protein Crystals

Опубликовано: 27.07.2017

Kurauskas, V.; Izmailov, S. A.; Rogacheva, O. N.; Hessel, A.; Ayala, I.; Woodhouse, J.; Shilova, A.; Xue, Y.; Yuwen, T.; Coquelle, N.; Colletier, J.-P.; Skrynnikov, N. R.; Schanda, P. Slow Conformational Exchange and Overall Rocking Motion in Ubiquitin Protein Crystals. Nature Communications 2017, 8 (1).

DOI: 10.1038/s41467-017-00165-8.

Читать далее »

Тэги: , ,

Конференция Института Трансляционной Биомедицины СПбГУ «Актуальные проблемы трансляционной биомедицины — 2017»

Опубликовано: 16.07.2017

dna-2358911.1961d33827f555101ee91d38be0ea3583237

15-16 июля 2017 года состоялась III ежегодная конференция Института Трансляционной Биомедицины СПбГУ «Актуальные проблемы трансляционной биомедицины — 2017». Конференция объединяет учёных ИТБМ всех направлений, а также приглашенных ученых, работающих в смежных областях, из Санкт-Петербурга, Москвы и из-за рубежа.

В конференции приняли участие Николай Скрынников, Иван Подкорытов, Дмитрий Лузик, Ольга Рогачева, Севастьян Рабдано, Сергей Измайлов, Али Шабан и Олег Михайловский.

Николай Скрынников представил лекцию “Обзор исследований в области экспериментальной биофизики, клеточной биологии и компьютерного моделирования, проводимых в Лаборатории биомолекулярного ЯМР СПбГУ”.

Иван Подкорытов представил постер “Применение ЯМР эксперимента с диффузионным фильтром для детектирования сигнала гибкой части амилоидных фибрилл Sup35NM”.

Дмитрий Лузик представил постер “Ковалентное связывание пептидного лиганда с SH2 доменом Fyn киназы и его последствия в виде агрегации и снижения структурной стабильности домена”.

Ольга Рогачева представила постер “Новое взаимодействие между группой NH3+ лизина и карбонилами основной цепи, дополняющее водородные связи”.

Севастьян Рабдано представил постер “Потеря структуры и агрегация белка при возникновении дисульфидных мостиков под воздействием окислительного стресса: пример домена RRM2 из нейропатологического белка TDP-43”.

Сергей Измайлов представил постер “Простая модель оксидативного сворачивания пептидов и белков в молекулярной динамике”.

Али Шабан представил постер “Библиотека Матлаб для аппроксимации сигналов в двумерных ЯМР спектрах”.

Тэги: , , , , , ,

Spinus 2017 – Магнитный резонанс и его приложения

Опубликовано: 29.04.2017

spinus

Николай Скрынников, Владислав Саликов и Севастьян Рабдано приняли участие в конференции Spinus 2017 — Магнитный резонанс и его приложения.

Николай Скрынников представил лекцию “Recent results from the Laboratory of biomolecular NMR @ SPbGU: from mechanism of anti-cancer peptides to characterization of flexible tails in amyloid fibrils”.

Севастьян Рабдано представил устный доклад “Reconstruction of particle size-distribution from conjunction of NMR and DLS diffusion data”.

Владислав Саликов представил устный доклад “Analysis of NMR spectra of alizarin and alizarin red S”.

Тэги: , ,

TEDxSPBU

Опубликовано: 22.04.2017

Севастьян Рабдано был приглашен сделать доклад на локальном мероприятии TED – TEDxSPBU. Название доклада “Can we use negative impact of oxidants in positive way?”

Тэги:

BioHack 2017

Опубликовано: 05.03.2017

PogC4n9AZHE

XVJGuOFwPwM

0PCqt-a8DTU

Севастьян Рабдано, Сергей Измайлов и Дмитрий Лузик приняли участие в хакатоне по биоинформатике BioHack 2017.

Сергей Измайлов руководил командой, которая работала над проектом «Идентификация онкогенных белков в качестве мишеней для ковалентно связывающихся пептидов».

Дмитрий Лузик был в команде, которая работала над проектом «Интерактом протеоформ человека».

Севастьян Рабдано был в команде, которая работала над проектом «Исследование связанных состояний молекул воды в интерфейсах биомакромолекул». Его команда заняла третье место и была награждена организаторами.

Тэги: , ,

Origin of anti-tumor activity of the cysteine-containing GO peptides and further optimization of their cytotoxic properties

Опубликовано: 20.01.2017

srep40217-f8

Tyuryaeva, I. I., Lyublinskaya, O. G., Podkorytov, I. S. & Skrynnikov, N. R. «Origin of anti-tumor activity of the cysteine-containing GO peptides and further optimization of their cytotoxic properties» Scientific Reports 7, 40217 (2017).

DOI: 10.1038/srep40217

Читать далее »

Тэги: , , ,

Экспертный совет NIH

Опубликовано: 15.11.2016

Picture5

Николай Скрынников участвовал в экспертном совете NIH, Вашингтон, США, 15-17 ноября, 2016.

Тэги:

Chicago Areа NMR Discussion Group (CANMRDG)

Опубликовано: 05.11.2016

Picture4

Николай Скрынников организовал конференцию на 120 участников «Chicago Areа NMR Discussion Group (CANMRDG)», Милуоки, США, 5 ноября, 2016.

Тэги:

Dynamics in protein crystals: insights from MD simulations complement new solid-state NMR and X-ray data

Опубликовано: 03.09.2016

O. N. Rogacheva , S. A. Izmailov , V. Kurauskas , A. Shilova , P. Ma, Y. Xue, N. Coquelle, J. D. Haller, T. Yuwen, I. Ayala, A. Hessel, J. Woodhouse, O. Mikhailovskii, D. Willbold, J. Colletier, N. R. Skrynnikov, P. Schanda «Dynamics in protein crystals: insights from MD simulations complement new solid-state NMR and X-ray data» The FEBS Journal 283 (Suppl. 1), 237 (2016).

DOI: 10.1111/febs.13808

Читать далее »

Тэги: , ,

Gordon Research Conference on Diffraction Methods

Опубликовано: 17.07.2016

Pictur32

Николай Скрынников представил доклад “Motions of Protein Molecules Within the Crystalline Lattice” на конференции “Gordon Research Conference on Diffraction Methods“, Bates College, Мэн, США, 17-22 июля, 2016.

Тэги: